
近日,斯坦福大学Michael T. Longaker教授团队在《自然》杂志发表了一项里程碑式研究,首次系统揭示了肺纤维化进展与消退过程中的关键细胞与分子机制,并发现了具有治疗潜力的新型“促消退”成纤维细胞和抗纤维化蛋白。这一突破为肺纤维化这一“不治之症”带来了新的希望。

该研究通过小鼠模型了揭示纤维化消退的关键机制,并验证其在人类疾病中的潜在应用。该研究综合利用了组织学特征分析、单细胞测序(scRNA-seq)、Visium空间转录组和CODEX(PhenoCycler-Fusion)空间单细胞蛋白组等技术。
核心发现
01纤维化的动态组织学轨迹
高维纤维特征分析:通过机器学习算法分析博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型,量化了2,500多张胶原纤维图像,提取294个纤维结构特征(如长度、分支、孔隙度)。结果表明,纤维化进程(0-21天)伴随胶原结构紊乱,而消退阶段(28-49天)逐渐恢复。
关键特征:纤维化区域表现为纤维几何异质性(直径、轴长标准差增大),而健康区域以高孔隙度和像素对比度为特征。胶原含量和放射密度验证了这一轨迹。

02成纤维细胞亚型的动态变化
scRNA-seq分析:分析了超过10万个细胞,鉴定出两类关键成纤维细胞:
ECM分泌型(Csmd1+):在纤维化高峰期(PID14)富集,高表达胶原合成相关基因(如Col1a1、Spp1)。
促消退型(Cd248+):在消退阶段(PID35)富集,表达血管生成基因(如Cd248、Pdgfra)和抗炎因子。
功能验证:将促消退型成纤维细胞移植到纤维化小鼠肺中,显著减少胶原沉积并改善纤维结构,而ECM分泌型移植无此效果。

03表观遗传调控机制
scATAC-seq分析:发现纤维化阶段(PID14)成纤维细胞染色质开放区域富集促纤维化转录因子(如JUN、TGF-β通路基因),而消退阶段(PID35)则开放抗纤维化相关区域(如Bmp4、血管生成基因)。HES家族转录因子(Notch信号下游)在消退阶段活跃,提示发育相关通路的重激活。

04空间转录组与微环境异质性
Visium空间转录组:整合组织学与转录组数据,发现:
纤维化区域:富含ECM分泌型成纤维细胞,与ATII细胞互作,高表达促纤维化因子(如SERPINE2、Fn1)。
非纤维化区域:促消退型成纤维细胞与ATI细胞互作,表达抗纤维化因子(如PI16、补体基因)。

05人类IPF空间蛋白组的临床验证
CODEX空间蛋白组学:分析6例IPF和3例正常肺样本,确认:
CSMD1+成纤维细胞:富集于纤维化区域,与TGF-β1、CTHRC1等促纤维化分子共定位。
CD248+成纤维细胞:存在于低炎症区域,与MGP(基质Gla蛋白,已知抗纤维化因子)相关。
治疗潜力:PI16在人类肺切片中抑制纤维化,提示其作为治疗靶点的潜力。

研究通过跨物种、多组学的方法,系统揭示了肺纤维化进程中成纤维细胞异质性及微环境调控网络,为开发靶向抗纤维化疗法提供了重要理论依据和候选分子。
从“瘢痕形成”到“瘢痕消退”
Longaker团队通过博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型,发现纤维化过程存在“自然消退期”。这一发现颠覆了传统认为纤维化不可逆转的观点。团队创新性地结合单细胞测序、空间转录组学和机器学习算法,构建了从正常组织到纤维化高峰再到消退期的“伪时间”轨迹,揭示了纤维化不仅是胶原蛋白的堆积,更是纤维结构“质的紊乱”。
关键发现:两种成纤维细胞的“对决”
研究团队鉴定出两种截然不同的成纤维细胞亚群:
ECM分泌型成纤维细胞:高表达CSMD1,在纤维化高峰期富集,大量分泌胶原蛋白,是推动纤维化的“主力军”。
促消退型成纤维细胞:高表达CD248,在消退期特异性出现,其基因富集于血管生成、上皮增殖和炎症抑制等修复通路,具有“清除瘢痕”的能力。
空间转录组分析显示,这两种细胞处于不同的微环境:促纤维化细胞聚集在纤维化严重区域,与免疫细胞和内皮细胞相邻;而促消退细胞则更多出现在结构相对正常的区域,与肺泡上皮细胞相互作用。
肺纤维化:呼吸的“隐形杀手”
肺纤维化是一种以肺部组织逐渐被瘢痕组织替代为特征的慢性疾病,最终导致呼吸功能不可逆丧失。患者常表现为进行性加重的呼吸困难,临床诊断后中位生存期仅3-5年,被称为“类肿瘤疾病”。目前,全球约300万患者面临这一困境,现有药物仅能延缓病程,无法逆转纤维化。
潜在治疗策略
01细胞疗法
直接移植促消退型成纤维细胞,利用其“清除瘢痕”的能力逆转纤维化。斯坦福团队已在小鼠模型中验证其可行性,下一步将探索其在灵长类动物和人类中的效果。
02蛋白疗法
通过基因工程手段,将促消退细胞分泌的抗纤维化蛋白(如CD248相关蛋白)开发为药物,或通过小分子药物激活患者体内促消退细胞。
然而,斯坦福团队的发现为肺纤维化治疗开辟了全新方向。未来,通过进一步优化细胞制备工艺、开发免疫调节策略,细胞疗法有望成为逆转肺纤维化的“利器”,为数百万患者带来新生。
结 语
肺纤维化曾是医学界公认的“不治之症”,但斯坦福团队的突破性研究证明,通过精准调控成纤维细胞亚群,逆转纤维化并非遥不可及。随着细胞治疗技术的不断进步,未来或许能将这一“类肿瘤疾病”转化为可治愈的慢性病,让患者重获自由呼吸的权利。
参考文献
1:Nature 《Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs》
免责声明:本文旨在科普相关知识,不作为医疗指导意见
编辑|Zhang.ZG
审核|Geng.ZG